Fakultas Keguruan dan Ilmu Pendidikan Universitas Nusa Cendana (FKIP Undana) berdiri bersamaan dengan berdirinya Universitas Nusa Cendana pada tahun 1962. Pendirian FKIP Undana berdasarkanSurat keputusan Mentri Perguruan Tinggi dan Ilmu Pengetahuan Republik Indonesia Nomor 111 Tahun 1962 tanggal 28 Agustus 1962,diperkuat dengan Surat Keputusan Presiden Republik Indonesia Nomor 67 Tahun 1963 menetapkan berdirinya Universitas Nusa Cendana yang berkedudukan di Kupang terhitung mulai tanggal 1 September 1962. Fakultas yang ada pada waktu itu adalah Fakultas Keguruan dan Ilmu Pendidikan, Fakultas Pertanian, Fakultas Peternakan, Fakultas Ketatanegaraan dan Ketataniagaan.

Nama Universitas Negeri Nusa Cendana berdasarkan simpulan dari tiga nama yang diusulkan panitia pendiri yaitu Nusa Cemdana, Pradja dan Liura.Dari ketiga calon nama tersebut disepakati memilih nama Univesitas Nusa Cendana yang disingkat Undana. Universitas Nusa Cendana diresmikan pada tanggal 17 September 1962 bertempat di Ruang sidang DPRD Dati I Nusa Tenggara Timur.